三分之二业主不同意使用维修基金修层顶漏雨，

物业和业委会应依法处理维修基金使用问题。依据《物业管理条例》，顶楼漏雨属公共部位维修，物业应协调处理，业委会需配合。不及时处理可能导致房屋损坏加剧，影响居住安全。
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常见处理方式为协商、投诉或法律途径。先与业主协商，不成则向房地产行政主管部门投诉，或寻求法律援助，根据《物业管理条例》选择适当方式。
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应依法协调处理。具体操作：1.物业组织业主大会讨论，明确维修必要性；2.业委会协助申请维修基金，公示使用情况；3.若业主反对，物业需解释法律依据和后果；4.仍无法协调，建议通过法律途径解决，确保维修及时进行。